Начиная с версий 3.23.50 и 4.0.2, можно указать последний файл данных InnoDB как autoextend. Можно также увеличить табличную область, указав дополнительные файлы данных. Для этого необходимо остановить сервер MySQL, внести изменения в файл my.cnf, добавив новый файл данных к innodb_data_file_path, а затем запустить сервер MySQL снова.

На данный момент нельзя удалить файл данных из InnoDB. Чтобы уменьшить размер своей базы данных, необходимо воспользоваться mysqldump, чтобы сделать дамп всех своих таблиц, создать новую базу данных и импортировать таблицы в новую базу данных.

Если необходимо изменить количество или размер файлов журналов InnoDB, необходимо остановить MySQL и убедиться, что работа была завершена без ошибок. После этого нужно скопировать старые файлы журналов в безопасное место - на случай, если завершение работы было произведено с ошибками и потребуется восстановление базы данных. Затем следует удалить старые файлы журналов из каталога файлов журналов, внести изменения в my.cnf и снова запустить MySQL. InnoDB при запуске сообщит о создании новых файлов журналов.