Вы используете устаревший браузер. Этот и другие сайты могут отображаться в нём некорректно. Вам необходимо обновить браузер или попробовать использовать другой.
SNI, но пользователи windows xp в пролете (хотя, в firefox-е должно работать и в xp - он, вроде бы, не пользуется системной реализацией ssl).
Если же ограничиться одним сертификатом - один алиас можно задать в subject alternative name сертификата, плюс для субдоменов есть wildcard cerfiticates.
Сабдомены сразу отметаем и виндовс тоже, речь о реальном хостинге *nix+Apache. Одного алиаса тоже недостаточно их там 3 штуки. Получается SNI может то что мне надо?