1. Добавить в таблицу table2 поле ID - автоинкримент (ALTER TABLE table2...)
2. Добавить в таблицу table2 PRIMARY (ID) (ALTER TABLE table2...)
3. Создать таблицу rel_table1_table2 (create table rel_table1_table2 as select table1.id as table1_id, table2.id as table2_id from table1, table2 where table1.id=table2.[field])
4. Добавить индексы в rel_table1_table2 (ALTER TABLE rel_table1_table2 )
5. Удалить foreign key (ALTER TABLE table2...)