Удали столбец с автоинкрементом из таблицы, потом создай заново.
Если хочешь чтобы данные осталисьи поле проавтоинкрементировалось, то создай с not null autoincrement и primary key.
Вроде mysql должен заполнить сам.
Если нет, select into все данные, создание таблицы заново, перенос данных с помощью update .