Юзал когда-то утилиту M2D. Может коннектиться к MySQL, работать со структурой таблиц и данными, смотреть установки сервера. Есть query builder, можно делать репозиторий запросов, сохранять выборки, делать дамп.
Прога бесплатная и довольно древняя, где скачать - не знаю, ищи; если что - вышлю. По суьъективным ощущениям - довольно удобная. Весит до 2-х метров.