Скарирование папок ftp сервера

[Solid]

Поддиректории можно просканировать разными методами. Что приходит слёту: 1) рекурсией; 2) через обычный цикл, где есть массив с каталогами... добавление в конец массива, удаление с начала (array_shift()).
Насамом деле всё это проще паренной репы. Тебе бы следовало обычно окунуться в php.net и почитать доку.