goacher
как упаковать файлы в каталоге, зайдя туда через ФТП, я как-то не знаю. Лично я делаю так, как описано выше, пакую все в тарбол .tar, зайдя через ssh, а потом дома через любимый wget лью все себе на комп и разворачиваю обратно.
спасибо за помощь, нашел готовый скрипт, вот может кому то пригодиться
http://fdstar.net/2008/03/27/PHP_kak_zapakovat_soderjimoe_papki_v_ZIP_arhiv_na_servere.html