если вы сами окно открываете JavaScript-ом, то в свойствах данной функции можно указать, какие части окна будут показываться, так и прокрутку можно убрать
изначально же окно точно не знаю, но сделал бы так: при каждой попытке прокручивания посылал бы прокрутку опять на нулевую позицию (хотя не знаю, насколько такое работает)
А зачем запрещать прокрутку?? Это же юзабильность уменьшает