Из подобного рода утилит пользовался лишь xDebug, для поиска "долго выполняющегося" куска кода. А как Вы ищите узкие места проекта? имею ввиду в общих чертах... у самого мысли подобные - сам код xDebug и т.п., база - slowlog, fs - ???
Юбилейный DevConfX пройдет 21-22 июня в Москве. Как всегда — Вы решаете, кто попадет в программу секции Backend — голосуйте за интересные доклады