А теперь представь, что человек активно юзал твой сайт, пользовался, скажем, блогом, форумом, постил новости, скачивал файлы, его id засветился в туевой хуче таблиц. Если ты удалишь только его запись в таблице юзеров - получишь кучу записей в таблицах с неизвестным id. Если твой движок при регистрации ищет первый неиспользованный id, то авторство этих записей в таблицах перейдет к зарегистрировавшемуся человеку. Даже если ты удалишь все записи, где засветился этот id, то обязательно (по закону Мерфи) найдется запись в некой таблице, которая ссылалась на одну из удаленных записей. В итоге ты получишь хаос.
Надеюсь апокалиптическая картина получилась достаточно яркой -)