На самом деле делаю так:
$user=$_SERVER['PHP_AUTH_USER'];
$conn=mssql_connect('CTE-SERVER', $user, $_SERVER['PHP_AUTH_PW']);
Т.е. под каким логином заходим на страничку, под тем и к серерверу коннектимся
Нет, это я к примеру написала, т.е. считаем, что doman - это название домена что ли. Вот двойная косая черта между доменом и логином меня смущает. Может в ней дело? Переменная $_SERVER['PHP_AUTH_USER'] как раз и содержит значение 'doman\\user1'.