1. логика работы с базой реализуется атомарными операциями и выносится в хранимые процедуры, которые, кроме обеспечения целостности, еще и доступ контролируют, и логи пишут, и расчеты нужные выполняют
2. операции не выполняются автоматически (как на freelance.ru)
под каждый платеж распечатывается ордер/ведомость, подписывается исполнителем, начальником, контролером, и так же в опердне ими же помечается,
а внешние платежи еще проверяются каким-нибудь казначейством, потом руками отдельным операционистом вбиваются в систему центробанка или SWIFT (как это в центробанке - не знаю)
вообще, на нижнем уровне почти не пишут - обычно покупается готовая система, на которую дописывается отчетность, интерфейсы и т.п. на основе существующего API
скорость исполнения - последнее, о чем думают, что потом создает проблемы "на местах"