Для "удобства чтения-навигации" возможно стоит:
- провести рефакторинг и разбить один класс на несколько;
- установить редактор, в котором встроена навигация по методам.
в чем суть безопасность или недоработка
имхо, смысла в этом нет, если б разработчики занимались всякой ерундой, то PHP5 ещё не было бы
