1) есть. в апаче есть файл runtime конфигурации per-directory
2) Интересный, кстати, вопрос.
почему-то, никто надним не задумывался раньше.
мне кажется - вполне можно. наверное...
Не задумывались наверное потому, что никому в голову не приходило лечить файлы, похеренные в результате кривых натроек сервера. Хотя, чисто теоретически, можно. наверное...