Вы используете устаревший браузер. Этот и другие сайты могут отображаться в нём некорректно. Вам необходимо обновить браузер или попробовать использовать другой.
Я пользуюсь SmartFTP и там в окошке в котором указыывается какие права назначать есть галочка при помощи которой можно заставить SmartFTP устанавливать права рекурсивно.